|
Выпуск 692 Лаборатория Наномир Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и меркнут чудеса ... Секреты пикотехнологии Материал с форума лаборатории
Наномир: Виктория Соколик: Угол омега как раз перекодируется в виде ротамера пептидной связи, т.е. тот оборот по оси пептидной связи, который реализуется при её формировании. Кушелев: Уважаемая Виктория! На Вашей схеме тРНК показано изменение только одного угла фи. Два других угла (пси и омега) в наших с Вами моделях не меняются. А угол вокруг оси вторичной структуры можно рассчитать при переходе из одной системы отсчета в другую. Для этого форму молекулы менять не нужно. Я сейчас покажу оба угла (вдоль разных осей) на модели. В случае пи-спирали угол вокруг оси вторичной
структуры я обозначил "пи". Угол фи при этом равен 120 градусам. 
В случае альфа-спирали угол вокруг оси вторичной структуры я обозначил "альфа". Угол фи при этом равен 0 градусам.
В случае бета-спирали угол вокруг оси вторичной структуры я
обозначил "бета". Угол фи при этом равен 180 градусам. В случае 310-спирали угол вокруг оси вторичной структуры я обозначил "дзета (зита)". Угол фи при этом равен 20 градусам. 
Видео, на котором я показываю связь угла фи с углом вокруг оси вторичной структуры на примере 310-спирали: https://radikal.ru/video/AKbYm2sf0cY Текст на видео: "Транспортная РНК поворачивает аминокислоту на угол фи. Для 310-спирали угол фи равен 20 градусов. При этом на виток 310 спирали приходится 3 аминокислотных остатка, т.е. вокруг оси симметрии вторичной структуры (310-спирали) угол 120 градусов. И никакого фолдинга." Обсуждение
Знакомьтесь, Павел Ошмера, пикотехнолог из Чехии  https://www.vbripress.com/aml/pdf/1342 https://www.vbripress.com/aml/uploadsnew/1549089125_fullabstractpdf.pdf 
Материал с форума лаборатории Наномир: Pavel Osmera:Здравствуйте, Александр Я преподаю информатику и физическую химию как хобби, поэтому я могу позволить себе нетрадиционный взгляд на структуры атомов и молекул. По стечению обстоятельств я вступил в дискуссию с проф. Zmeškal c химического факультета, занимающимся фрактальным описанием. Ему удалось вывести все основные
отношения с помощью фрактальной размерности. Мне стало интересно, какие структуры могут быть задействованы. В то время я купил в Сингапуре соединитель для соединения двух бутылок из ПЭТ за 3 доллара. Я называю это «теорией трех долларов». Как компьютерная наука, я был заинтригован, как хаотическая структура может быть преобразована в вихревую структуру, проходя через отверстие (1 см). Я думал об аналогии с электромагнитной структурой света. Затем я начал изучать физику и химию. Я посещаю
конференции, посвященные оптимизации сложных систем, вдохновленных природой (эволюционная оптимизация, например, грамматическая эволюция). Чтобы создать вихрь, структура должна иметь отверстие и спин 1/2. Для этого подходит только кольцевая структура (тороид). Затем я попытался объяснить известные свойства атомов и молекул с помощью кольцевой модели. Оказалось, что эта модель может объяснить и количественно описать ряд явлений.
Электроны на тех
же сферических квантовых уровнях могут перепрыгивать через сферическую поверхность и, таким образом, заполнять статистически заданную квантовую сферу. С уважением,
Ваш Павел I teach computer science and physical chemistry as a hobby so I can afford to have an unconventional view of the
structures of atoms and molecules. By coincidence I got into a discussion with prof. Zmeškal from the Faculty of Chemistry, dealing with fractal description. He managed to derive all the basic relationships by means of a fractal dimension. I became interested in what structures might be involved. At that time, I bought a connector for connecting two PET bottles in Singapore for $ 3. I call it the "three dollar theory". I was intrigued as a computer science how a chaotic structure can be
transformed into a vortex structure by passing through a hole (1 cm). I thought of it be the electromagnetic structure of light. Then I began to study physics and chemistry. I attend conferences that deal with the optimization of complex systems that have been inspired by nature (evolutionary optimization, eg grammatical evolution). In order to create a vortex, the structure must have a hole and a spin 1/2. Only the ring structure (toroid) is suitable for this. Then I tried to explain the known properties
of atoms and molecules using a ring model. It turned out that this model can explain and count a number of phenomena.
Electrons at the same spherical quantum levels can jump across a spherical surface and thus fill a statistically given quantum sphere. 
Кушелев: Здравствуйте, Павел! Благодарю! В общих чертах понятно. Но хотелось бы уточнить, каким образом Вы пришли к выводу, что "Для этого подходит только кольцевая структура (тороид) / Only the ring structure (toroid) is suitable for this."
Этот вывод Вы сделали в результате логических
рассуждений, расчётов или озарения (интуитивно)? Мне интересно понять технологию Вашего научного открытия. В конечном счёте технологии научных открытий, их систематизация помогут создать индустрию научных открытий в т.ч. в фундаментальной науке. Индустрия научных открытий - это то, что катастрофически не хватает нашей цивилизации. Вы пишите: "я могу позволить себе нетрадиционный взгляд..."
Кушелев: Научное открытие - это "ревизия традиций". В рамках "традиционного взгляда" научные открытия невозможны  Парадоксальность
ситуации в данном случае заключается в том, что открытие кольцевой формы элементарных частиц, в частности электрона, возвращает фундаментальную науку, в частности, физику на традиционный, классический путь Ньютона и Максвелла. Нетрадиционный по отношению к нетрадиционному (релятивистскому, квантовому) взгляду оказался более традиционным Благодарю за дополнительные научные материалы. Буду изучать. Под каким ником зарегистрировать Вас на форуме лаборатории Наномир? Pavel Osmera или у Вас есть другие варианты? Хотелось бы услышать и ответ на вопрос, "Допускаете ли Вы, что расстояние между электронами в электронной оболочке может быть меньше, чем большой/малый радиус тора-электрона?" Вы прислали описание прибора для обработки воды. Вы не могли бы разместить на форуме лаборатории Наномир рекламные материалы по этой теме? Я бы создал для этого отдельную тему: http://nanoworld.org.ru/topic/2202/
Название можно изменить по Вашему усмотрению. С уважением и теплыми пожеланиями, 
Обсуждение
Создан онлайн сервис "Определение структуры белка по нуклеотидной последовательности" Профессиональный онлайн-сервис Определены структуры всех белков человека Часть 1 Часть 2 
3D генетический код
подтвержден методами РСА, ЯМР и КД: 
На базе научного открытия нами создан онлайн-сервис по определению структуры белковых молекул. Теперь мы сможем зарабатывать вместе.
Презентация для заказчиков белковых структур По старой технологии определение одной структуры белка обходится примерно в 10 000 евро, а ждать нужно от 2 месяцев до 3 лет. По новой технологии структура определяется в 1000 раз точнее и в миллиард раз быстрее. 80%
от найденного Вами заказа принадлежат Вам, как менеджеру. Наш лозунг: "В 1000 раз лучше, в 1000^3 быстрее и в 1000 раз дешевле!" Ваша задача заключается в размещении рекламы на онлайн-сервис белковых структур. Рынок этих структур очень большой и продолжает стремительно расти. Ежедневно кто-то оплачивает до 60 структур по средней цене 10 000 евро за штуку. Новая технология позволила на одном персональном компьютере за неделю определить структуры всех 115 000 белков человека, для которых известна нуклеотидная кодирующая последовательность. При этом качество результата, полученного по новой технологии в 1000 раз
выше по точности, в миллиард раз по быстродействию и в 30 раз шире по номенклатуре белковых молекул. Единственное, что нам сегодня не хватает - рекламы. Как получить Вашу первую зарплату менеджера? Найти заказчика белковых структур и убедить его заказать за счёт лаборатории Наномир пробный заказ. Когда заказчик распробует новую технологию, он начнёт делать коммерческие заказы. С первого коммерческого заказа менеджер получает 80%. С последующих заказов процент будет постепенно уменьшаться, но с первого заказа другого заказчика менеджер снова получит 80%. Зарплата менеджера может достичь миллиона евро в день. И это не
предел. 
Фрагмент модели лизоцима, замкнувшийся через дисульфидный мостик в процессе
автоматической сборки по таблице композиционного генетического кода.
"Монстр" первой хромосомы человека насчитывает 5207 аминокислотных остатков. Вторичная структура белка в компактном изображении: 
Первая 1000 белковых структур за счёт лаборатории Наномир (по старой технологии это стоило бы 10 миллионов евро). Обсуждение
Инвестирование научных проектов
Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D
и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок. Всё, что необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой
нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB). В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а также файл .pdb с координатами каждого атома белка. Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами. Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структуре Вашего белка. Сотрудничество может быть различным: - участие в научных дискуссиях на форуме (конструктивное) - совместное создание коммерческого продукта - поиск инвесторов - выступить менеджером по продаже готовых коммерческих продуктов -
конструктивные предложения по продвижению идей лаборатории Наномир - содействие в проведении экспериментов и т.п.
- написание совместных научных статей и т.п. - материальный вклад (денежный или обеспечение оборудованием и материалами)
Пожалуйста, сообщайте о своем вкладе, чтобы мы зачли Вас как партнера лаборатории Наномир. +7-926-5101703, +7-903-2003424, +7-916-8265031, mail: kushelev20120@yandex.ru
Карта VISA Сбербанка 4276400045661130 PayPal: kushelev20120@yandex.ru (вариант перевода друзьям) веб-мани: WM-кошелек R426964799301 Кошелек Яндекс-деньги: 410011905885672 Огромное спасибо всем за помощь и поддержку!
|
