718 Обнаружена связь между колокольными перезвонами и биологической активностью!
Выпуск 718
Лаборатория Наномир
Когда реальность открывает тайны, уходят в тень и меркнут чудеса ...
Обнаружена связь между колокольными перезвонами и биологической активностью!
Вы видите ноты мелодии сборки программной спирали белка KAE8584295.1 Под эту мелодию собираются активные центры белковой
молекулы, который в данном случае образуют спираль. Мы уже знаем, что гармоничные аккорды активных центров позволяют дистанционно управлять химическими реакциями, поворачивая и соединяя/разъединяя молекулы. Любопытно, что конкретная мелодия напоминает колокольный перезвон. Может ли колокольный перезвон тоже управлять какими-либо процессами, кроме передачи сигнала людям? Вполне возможно, что оригинальные колокола могли включаться ударом. Материал об этом уже проходил на форумах и в
рассылке:
Однако силовое воздействие звука колоколов представляется маловероятным. Другое дело - создание
фрактального акустического поля на местности, которое можно анализировать сканирующими зондами в виде мелких "летающих тарелок". Может ли такое акустическое поле использоваться в качестве распределённого в пространстве фрактального сигнала управления? Ответ на этот вопрос можно получить в результате научного исследования. Если Вам интересна эта тема, подключайтесь!
Альфа-бета-, Альфа-310-пи- и другие многозаходные фрактальные программные спирали.
Эта фрактальная трёхзаходная
спираль состоит из двух заходов альфа-спиральных участков (красный) и одного захода бета-спиральных участков (зеленый).
Три захода этой фрактальной спирали образованы альфа- (красный), 310- (оранжевый) и пи- (синий) спиральными участками соответственно.
Эту фрактальную спираль многозаходной можно назвать лишь условно, т.к. в наличии только прямые пи-спиральные участки (синий). Участки альфа-310-спирали (оранжевый-красный) образуют скруглённый заход резьбы, а участок программной спирали, образует фигурный заход.
Заходы этой фрактальной спирали вообще гибкие, т.е. могут менять профиль, а значит глубину и ширину. Это связано с наличием суставов Pro (желтый).
Сколько заходов у этой фрактальной спирали? Это
зависит от угла между соседними "гранями"-заходами. Интересно было бы сделать 3D модель этой фрактальной программной спирали, но для этого ещё предстоит доделать 3D версию программы Пикотех...
На какой угол "ломает" альфа-спираль (красный) пи-код (голубой)? Если на 60 градусов, то перед
нами схема трёхгранной призмы.
Заход фрактальной спирали, образованный альфа-спиральными участками (красный) жёсткий, а заход, образованный пролинами (желтый) может быть мягким и "дышать" в процессе функционирования белковой спирали.
Наличие пролиновых заходов фрактальной спирали может говорить о том, что перед нами - механизм, который может двигаться подобно змеям или червям.
Двойной пролин PP (желтый) это двойной сустав, а по
существу шарнир. Фрактальная спираль с шарнирными заходами...
Фрактальные белковые спирали можно обнаружить уже на уровне схемы вторичной структуры. И далее исследовать их структуру уже с помощью программы Пикотехнология 3D.
Пролин (желтый) в структуре программной спирали может выполнять функцию юстировки витков, т.е. чтобы витки спирали складывались в структуру фрактальной спирали, чтобы между витками не было зазоров, чтобы могли образоваться межвитковые, например, водородные связи.
Переход альфа-спирали в 310-спираль и обратно не приводит к изгибу спирали. Меняется только число аминокислотных остатков на виток. Изгиб/излом спирали происходит при переходе альфа-310-спирали в другую, например, пи-спираль (голубой), как в данном случае.
Пи-спираль (синий) переходит в
альфа-спираль (красный), образуя два соседних захода фрактальной спирали. Между этими заходами получается жесткий, острый угол, кромка резьбы. Обратный переход от пи-спиральных участков к альфа-спиральным может быть сглаженным. Выпуклым или вогнутым.
Длинный участок альфа-спирали длиннее, чем два коротких. Это означает, что фрактальная спираль
не может быть трёхзаходной. Это значит, что угол, на который поворачивает альфа-спираль на одиночном коде пи-спирали не может быть 60 градусов. Скорее всего он равен 120 градусам. В этом случае получается 6-гранная призма, напоминающая по пропорциям кристалл сахара.
Программные спирали белков очень удобны для точного определения углов перехода одного типа спирали в другой. Исследование программных спиралей поможет составить таблицу переходов для новой версии программы Пикотех-3D.
Это позволит определять пространственные структуры белков по табличным функциям, т.е. даже без учёта физики, а значит практически мгновенно.
Если Вы желаете ускорить создание новой версии программы Пикотех 3D, подключайтесь. Ведь это - будущее молекулярной биологии...
По старой технологии
определение одной структуры белка обходится примерно в 10 000 евро, а ждать нужно от 2 месяцев до 3 лет. По новой технологии структура определяется в 1000 раз точнее и в миллиард раз быстрее. 80% от найденного Вами заказа принадлежат Вам, как менеджеру.
Наш лозунг: "В 1000 раз лучше, в 1000^3
быстрее и в 1000 раз дешевле!"
Ваша задача заключается в размещении рекламы на онлайн-сервис белковых структур. Рынок этих структур очень большой и продолжает стремительно расти. Ежедневно кто-то оплачивает до 60 структур по средней цене 10 000 евро за штуку. Новая технология позволила на одном
персональном компьютере за неделю определить структуры всех 115 000 белков человека, для которых известна нуклеотидная кодирующая последовательность. При этом качество результата, полученного по новой технологии в 1000 раз выше по точности, в миллиард раз по быстродействию и в 30 раз шире по номенклатуре белковых молекул. Единственное, что нам сегодня не хватает - рекламы.
Как получить Вашу первую зарплату менеджера? Найти заказчика белковых структур и убедить его заказать за счёт лаборатории Наномир пробный заказ. Когда заказчик распробует новую технологию, он начнёт делать коммерческие заказы. С первого коммерческого заказа менеджер получает 80%. С последующих заказов процент будет постепенно уменьшаться, но с первого заказа другого заказчика менеджер снова получит 80%. Зарплата менеджера может достичь миллиона евро в день. И это не
предел.
Фрагмент модели лизоцима, замкнувшийся через дисульфидный мостик в процессе автоматической сборки по таблице композиционного генетического кода.
"Монстр" первой хромосомы человека насчитывает 5207 аминокислотных остатков.
Словарь вторичных структур:
Подробнее:
Вторичная структура белка (фрактальная программная спираль) в компактном изображении:
Первая 1000 белковых структур за счёт лаборатории Наномир (по старой технологии это стоило бы 10 миллионов евро).
Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок.
Всё, что
необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB).
В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а
также файл .pdb с координатами каждого атома белка.
Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами.
Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структуре Вашего белка.
Сотрудничество может
быть различным:
- участие в научных дискуссиях на форуме (конструктивное)
- совместное создание коммерческого продукта
- поиск инвесторов
- выступить менеджером по продаже готовых коммерческих продуктов
- конструктивные предложения по продвижению идей лаборатории Наномир
- содействие в проведении экспериментов и т.п.
- написание
совместных научных статей и т.п.
- материальный вклад (денежный или обеспечение оборудованием и материалами)
Пожалуйста, сообщайте о своем вкладе, чтобы мы зачли Вас как партнера лаборатории
Наномир.
Если выпуск не отображается, вы можете прочесть его
на сайте
Это сообщение было отправлено на e@mail потому, что вы подписались на рассылку
science.news.nanoworldnews
на subscribe.ru.
Чтобы гарантировать получение писем от нас — добавьте наш адрес в адресную книгу.
Пролин (желтый) в структуре программной спирали может выполнять функцию юстировки витков, т.е. чтобы витки спирали складывались в структуру фрактальной спирали, чтобы между витками не было зазоров, чтобы могли образоваться межвитковые, например, водородные связи.
Переход альфа-спирали в 310-спираль и обратно не приводит к изгибу спирали. Меняется только число аминокислотных остатков на виток. Изгиб/излом спирали происходит при переходе альфа-310-спирали в другую, например, пи-спираль (голубой), как в данном случае.
Пи-спираль (синий) переходит в
альфа-спираль (красный), образуя два соседних захода фрактальной спирали. Между этими заходами получается жесткий, острый угол, кромка резьбы. Обратный переход от пи-спиральных участков к альфа-спиральным может быть сглаженным. Выпуклым или вогнутым.
Длинный участок альфа-спирали длиннее, чем два коротких. Это означает, что фрактальная спираль
не может быть трёхзаходной. Это значит, что угол, на который поворачивает альфа-спираль на одиночном коде пи-спирали не может быть 60 градусов. Скорее всего он равен 120 градусам. В этом случае получается 6-гранная призма, напоминающая по пропорциям кристалл сахара.
